PLATFORM INTRODUCTION
平臺介紹
科研合作
平臺介紹
末端修飾-單堿基延伸法TM-SBE:當所需檢測的DNA濃度極低時(例如cffDNA和CTC),可用生物素標記的ddNTP作SBE的底物,成功延伸的片段可以被avidin耦聯的磁珠吸附,從而富集,達到所需的檢測濃度。
技術原理
質譜:試樣中的組分在離子源中發生電離,形成不同荷質比的帶電離子,經加速電場作用形成離子束,先后轟擊在檢測器,并經電腦收集計算得到對應譜圖。
核酸質譜的技術優勢
基于SBE和MALDI-TOF MS搭建的massarray核酸質譜系統,在樣本選擇、實驗耗時、花費、結果準確性和可重復性等方面,均有很大的優勢 。
1、高靈活性和可擴展性
可選購預裝的檢測panel,也可以自行通過agena網站的ADS線上程序設計多重引物組合,最高40重。有24、96、384孔可供選擇。
2、適用多種樣本,靈敏度和準確度高
一輪擴增子長度80-120bp,起始DNA量可低至5pg,cfDNA、FFPE等低溶度、片段化的模板均適用。SBE和質譜技術的結合,使檢測結果可信度顯著上升
3、時間成本和經濟成本低
所用引物無需特殊標記,操作過程同板同孔,中間無轉板和純化步驟,自動化程度高,手動操作時間短,8小時即可完成最多2快384孔板的檢測
4、結果自動分析,實驗可重復性高
系統自帶的Typer軟件,能夠自動解析譜圖,給出完善的分析結果。相較熒光PCR,質譜通過讀取核酸的分子量,從而提供一種更加準確、重復性高的試驗方法
應用
NGS的完美搭檔:由于MassARRAY系統兼容各種來源和質量的DNA樣品,且相比NGS,操作更加簡便,時間和經濟花費更少,因此,是使用NGS檢測前,對核酸樣品進行質控和鑒定的優先選擇。