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MLH1基因甲基化檢測(cè)的應(yīng)用與思考

新聞來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:[2024-02-27]

前言

MLH1基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化是結(jié)直腸癌(CRC)和子宮內(nèi)膜癌(EC)常見的表觀遺傳改變,甲基化導(dǎo)致基因沉默,從而導(dǎo)致微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI-H)。通常,MLH1高度甲基化被認(rèn)為是癌癥中的散發(fā)性事件,其檢測(cè)被認(rèn)為是區(qū)分散發(fā)性和遺傳性疾病(林奇綜合征)的有用工具。其在子宮內(nèi)膜癌的診療中,亦有一些擴(kuò)展性的應(yīng)用。


MLH1甲基化在林奇綜合征篩查中的應(yīng)用

林奇綜合征也稱為遺傳性非息肉病性結(jié)直腸癌(HNPCC)綜合征(OMIM 120435),約占所有CRC的2%~4%,占所有EC的3%~5%。其由錯(cuò)配修復(fù)(MMR)基因MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的胚系突變引起,并與腫瘤組織中的MSI-H有關(guān)。林奇患者發(fā)生CRC和EC的風(fēng)險(xiǎn)較高(分別高達(dá)80%和60%),并且有發(fā)生其他癌癥類型(如胃癌、小腸癌、尿路上皮癌和卵巢癌)的風(fēng)險(xiǎn)。MLH1和MSH2基因的變異占林奇發(fā)病的大部分,發(fā)生率分別為40~50%和40~60%,而MSH6(10~20%)和PMS2(2%)的發(fā)生率較低。

臨床上對(duì)于林奇綜合征相關(guān)腫瘤患者,一般優(yōu)先推薦進(jìn)行MMR蛋白免疫組織化學(xué)檢測(cè)。發(fā)生MLH1蛋白缺失時(shí),MLH1基因啟動(dòng)子甲基化或BRAF V600E檢測(cè)(僅適用于CRC)常用于判讀散發(fā)性腫瘤。BRAF V600E致病突變僅在69%的甲基化CRC中被發(fā)現(xiàn),因此無(wú)BRAF V600E突變不能排除MLH1甲基化。EC患者BRAF基因突變頻率極低,且與MLH1基因啟動(dòng)子甲基化不相關(guān),因此篩查林奇綜合征時(shí)無(wú)需檢測(cè)BRAF V600E突變。

曼徹斯特共識(shí)推薦的EC患者林奇綜合征篩查流程


雖然MLH1啟動(dòng)子甲基化和胚系MLH1變異通常被認(rèn)為是兩種相互排斥的機(jī)制,仍有一些罕見病例報(bào)道MLH1高度甲基化見于致病性MLH1胚系突變或表突變攜帶者中,體系MLH1甲基化可能是林奇綜合征中MLH1沉默的二次打擊。最近意大利的一項(xiàng)研究采用高通量測(cè)序(NGS)和甲基化特異性多重連接探擴(kuò)增(MS-MLPA)等技術(shù)研究了56例林奇患者。在MLH1胚系致病突變患者中,16.7%(3/18)的CRC和40%(4/10)的EC發(fā)現(xiàn)了體系MLH1啟動(dòng)子高度甲基化。雖然這只是單個(gè)研究報(bào)道且病例較少,但仍提示應(yīng)注重患者的家族史和個(gè)人病史。當(dāng)臨床高度懷疑林奇綜合征時(shí),無(wú)論MMR狀態(tài)如何,均應(yīng)進(jìn)行林奇綜合征相關(guān)基因胚系突變檢測(cè)確診。


MLH1甲基化在子宮內(nèi)膜癌預(yù)后中的應(yīng)用

MLH1基因啟動(dòng)子甲基化與EC的預(yù)后相關(guān)。日本的一項(xiàng)研究采用免疫組化和MS-MLPA分析了527例EC樣本,419例(79.5%)為錯(cuò)配修復(fù)功能正常(pMMR),65例(12.3%)為疑似林奇(MSH2/MSH6蛋白缺失或MLH1/PMS2蛋白缺失但MLH1未甲基化)和43例(8.2%)為met-EC(MLH1/PMS2蛋白缺失且MLH1高度甲基化)。與疑似林奇患者相比,MLH1甲基化的EC預(yù)后顯著更差。

各亞組的生存分析


MLH1甲基化與EC免疫治療的預(yù)后亦相關(guān)。單臂、開放標(biāo)簽的II期研究(NCT02899793),在復(fù)發(fā)性dMMR/MSI-H EC患者中評(píng)估了帕博利珠單抗的療效,200 mg Q3W靜脈注射,持續(xù)24個(gè)月。主要終點(diǎn)為根據(jù)RECIST v1.1標(biāo)準(zhǔn)的ORR和毒副反應(yīng),次要終點(diǎn)包括PFS和OS。19例患者存在MLH1啟動(dòng)子甲基化,6例患者攜帶林奇樣腫瘤,1位患者二者皆有,沒有胚系突變的林奇綜合征患者。中位隨訪25.8個(gè)月后,林奇樣患者的ORR為100%,甲基化患者僅有44%(p=0.024)。3年的PFS為100%比30%(p=0.017),OS為100%比43%(p=0.043)。

腫瘤應(yīng)答的瀑布圖

亞組之間的生存分析


MLH1甲基化在子宮內(nèi)膜癌分子分型中的應(yīng)用

MLH1基因啟動(dòng)子甲基化雖然并非EC分子分型的標(biāo)志物,但其對(duì)于分子分型亦有提示作用,尤其是在不同方法學(xué)分型結(jié)果不一致的時(shí)候。北京大學(xué)第三醫(yī)院病理科近期發(fā)表在中華婦產(chǎn)科雜志上的文章《子宮內(nèi)膜癌分子分型中錯(cuò)配修復(fù)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性狀態(tài)的綜合評(píng)估》論證了這一點(diǎn)。文章針對(duì)214例EC患者,通過MMR免疫組化和NGS(非飛朔產(chǎn)品)進(jìn)行了分析。對(duì)于MMR-IHC檢測(cè)與MSI-NGS檢測(cè)結(jié)果不相符的患者進(jìn)一步進(jìn)行MSI-PCR檢測(cè)和MLH1基因啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)(飛朔產(chǎn)品)。

40例散發(fā)性MMR-d型EC患者中,MLH1和/或PMS2蛋白表達(dá)缺失31例,其中20例檢出MLH1基因啟動(dòng)子甲基化,1例未檢出甲基化,10例因腫瘤組織不足而未進(jìn)行甲基化檢測(cè)。

共有9例患者M(jìn)MR-IHC與MSI-NGS檢測(cè)結(jié)果不一致,主要為MLH1和PMS2蛋白表達(dá)共缺失或亞克隆共缺失患者,6例檢出MLH1基因啟動(dòng)子甲基化。3例MSI-PCR驗(yàn)證結(jié)果為MSI-L的患者中,2例患者的TMB值較高,且存在MLH1基因啟動(dòng)子甲基化,因此也歸入MMR-d。1例患者因DNA樣本量不足未進(jìn)行MSI-PCR檢測(cè),但結(jié)合MLH1和PMS2蛋白表達(dá)共缺失,并檢出了MLH1基因啟動(dòng)子甲基化,也符合MMR-d。

MMR-IHC與MSI-NGS檢測(cè)結(jié)果不一致的具體分析


MMR-IHC與MSI-NGS檢測(cè)結(jié)果不一致多見于MLH1基因啟動(dòng)子高度甲基化狀態(tài)導(dǎo)致的MLH1和PMS2蛋白表達(dá)共缺失或MMR蛋白亞克隆缺失,必要時(shí)應(yīng)結(jié)合MLH1基因甲基化等檢測(cè)方法綜合評(píng)估MMR、MSI狀態(tài),為EC患者提供精準(zhǔn)的分子分型。


總結(jié)

對(duì)于MLH1蛋白表達(dá)缺失的EC,MLH1基因啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)有助于明確腫瘤的MMR、MSI狀態(tài),排除林奇綜合征的風(fēng)險(xiǎn),提示EC的預(yù)后,輔助治療方案的選擇,并且對(duì)分子分型也具有補(bǔ)充提示的作用。


參考文獻(xiàn)

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